Kiam la medio estas difektita, bioteknologio povas esti uzata por protekti la medion de sekundara damaĝo. Biologio estas tre specifa kaj povas elimini specialajn poluofontojn. Ekzemple, krozoŝipo transportanta nafton poluas la marareon per peza nafto pro akcidento. La specialaj mikrobaj trostreĉoj, kiuj malkomponas pezan oleon, estas uzataj por malkomponi la pezan oleon kaj metaboligi ĝin en medie akcepteblajn mallongajn ĉenajn grasacidojn por forigi la poluon. Krome, se la grundo estas poluita de pezaj metaloj, specifaj plantoj ankaŭ povas esti uzataj por sorbi poluajn fontojn.