जब वातावरण क्षतिग्रस्त हुन्छ, बायोटेक्नोलोजी प्रयोग गरी वातावरणलाई माध्यमिक क्षतिबाट बचाउन सकिन्छ। जीवविज्ञान अत्यधिक विशिष्ट छ र विशेष प्रदूषण स्रोतहरू हटाउन सक्छ। उदाहरणको लागि, कच्चा तेल ढुवानी गर्ने क्रूज जहाज दुर्घटनाको कारणले भारी तेलले समुद्री क्षेत्रलाई प्रदूषित गर्छ। भारी तेल सड्ने विशेष माइक्रोबियल स्ट्रेनहरू भारी तेललाई विघटन गर्न र प्रदूषण हटाउन वातावरणीय रूपमा स्वीकार्य छोटो चेन फ्याटी एसिडमा मेटाबोलाइज गर्न प्रयोग गरिन्छ। थप रूपमा, यदि माटो भारी धातुहरू द्वारा प्रदूषित छ भने, विशेष बिरुवाहरू पनि प्रदूषण स्रोतहरू अवशोषित गर्न प्रयोग गर्न सकिन्छ।