Quandu l'ambiente hè dannatu, a biotecnologia pò esse usata per prutege l'ambiente da danni secundari. A biologia hè assai specifica è pò eliminà e fonti di contaminazione speciale. Per esempiu, una nave di cruciera chì trasporta u petroliu crudu contamina a zona di u mare cù oliu pisanti per un accidentu. I ceppi microbichi spiciali chì decomponenu l'oliu pesante sò usati per scumpressà l'oliu pisanti è metabolizà lu in acidi grassi di a catena corta per l'ambiente per eliminà a contaminazione. Inoltre, se u tarrenu hè contaminatu da metalli pisanti, i pianti specifichi ponu ancu esse usatu per assorbe e fonti di contaminazione.