Teollisuudessa teollisten bakteerien erityistä aineenvaihduntareittiä käytetään korvaamaan joitain kemiallisia reaktioita. Spesifisyyden parantamisen lisäksi se säästää myös energiaa normaalissa lämpötilassa ja paineessa. Sitä kutsutaan myös vihreäksi teollisuudeksi sen korkean spesifisyyden ja vähäisen jätemäärän vuoksi.