פפטיד הוא חומר ביוכימי בין חומצת אמינו לחלבון. יש לו משקל מולקולרי קטן יותר מחלבון, אבל משקל מולקולרי גדול יותר מחומצת אמינו. זהו שבר של חלבון. כלומר, מיותר משניים או עד עשרות פילמור קשרי חומצות אמינו פפטידים לפפטיד, ולאחר מכן מפילמור של מספר פפטידים עם שרשראות צד לחלבון. חומצת אמינו לא יכולה להיקרא פפטיד, חייבת להיות יותר משתי חומצות אמינו מקושרות בתרכובת שרשרת פפטיד כדי להיקרא פפטיד; חומצות אמינו רבות המעורבבות יחד אינן נקראות פפטידים; חומצות אמינו חייבות להיות מקושרות בקשרים פפטידים, ויוצרות "שרשרת חומצות אמינו", "מחרוזת חומצות אמינו", מחרוזת חומצות אמינו יכולה להיקרא פפטיד. .