Айлана-чөйрө бузулганда биотехнология айлана-чөйрөнү экинчилик зыяндан коргоо үчүн колдонулушу мүмкүн. Биология өтө спецификалык жана атайын булгоо булактарын жок кыла алат. Мисалы, чийки мунай ташыган круиздик кеме кырсыктан улам деңиз аймагын оор мунай менен булгайт. Оор майды ажыроочу атайын микробдук штаммдар оор майды ажыратуу жана булганууну жок кылуу үчүн экологиялык жактан алгылыктуу кыска чынжырлуу май кислоталарына айлануу үчүн колдонулат. Мындан тышкары, эгерде топурак оор металлдар менен булганса, булгануу булактарын сиңирүү үчүн атайын өсүмдүктөр да колдонулушу мүмкүн.