പരിസ്ഥിതിക്ക് കേടുപാടുകൾ സംഭവിക്കുമ്പോൾ, ദ്വിതീയ നാശത്തിൽ നിന്ന് പരിസ്ഥിതിയെ സംരക്ഷിക്കാൻ ബയോടെക്നോളജി ഉപയോഗിക്കാം. ജീവശാസ്ത്രം വളരെ നിർദ്ദിഷ്ടവും പ്രത്യേക മലിനീകരണ സ്രോതസ്സുകളെ ഇല്ലാതാക്കാനും കഴിയും. ഉദാഹരണത്തിന്, ക്രൂഡ് ഓയിൽ കൊണ്ടുപോകുന്ന ഒരു ക്രൂയിസ് കപ്പൽ അപകടത്തെത്തുടർന്ന് കടൽ പ്രദേശത്തെ കനത്ത എണ്ണയാൽ മലിനമാക്കുന്നു. കനത്ത എണ്ണയെ വിഘടിപ്പിക്കുന്ന പ്രത്യേക മൈക്രോബയൽ സ്‌ട്രെയിനുകൾ കനത്ത എണ്ണയെ വിഘടിപ്പിക്കാനും മലിനീകരണം ഇല്ലാതാക്കാൻ പരിസ്ഥിതിക്ക് സ്വീകാര്യമായ ഷോർട്ട് ചെയിൻ ഫാറ്റി ആസിഡുകളായി രൂപാന്തരപ്പെടുത്താനും ഉപയോഗിക്കുന്നു. കൂടാതെ, കനത്ത ലോഹങ്ങളാൽ മണ്ണ് മലിനമായാൽ, മലിനീകരണ സ്രോതസ്സുകൾ ആഗിരണം ചെയ്യാൻ പ്രത്യേക സസ്യങ്ങളും ഉപയോഗിക്കാം.