Meta l-ambjent ikun bil-ħsara, il-bijoteknoloġija tista 'tintuża biex tipproteġi l-ambjent minn ħsara sekondarja. Il-bijoloġija hija speċifika ħafna u tista 'telimina sorsi speċjali ta' tniġġis. Pereżempju, bastiment tal-kruċiera li jittrasporta żejt mhux raffinat iħammeġ iż-żona tal-baħar b'żejt tqil minħabba inċident. Ir-razez mikrobiċi speċjali li jiddekomponu ż-żejt tqil jintużaw biex jiddekomponu ż-żejt tqil u jimmetabolizzawh f'aċidi grassi ta 'katina qasira ambjentalment aċċettabbli biex jeliminaw it-tniġġis. Barra minn hekk, jekk il-ħamrija hija mniġġsa minn metalli tqal, pjanti speċifiċi jistgħu wkoll jintużaw biex jassorbu sorsi ta 'tniġġis.