Ha a környezet károsodik, a biotechnológia segítségével megvédhető a környezet a másodlagos károktól. A biológia rendkívül specifikus, és képes kiküszöbölni a speciális szennyezőforrásokat. Például egy kőolajat szállító tengerjáró hajó egy baleset következtében nehézolajjal szennyezi a tengert. A nehézolajat lebontó speciális mikrobatörzsek segítségével a nehézolajat lebontják és környezetileg elfogadható rövid szénláncú zsírsavakra metabolizálják a szennyezés megszüntetése érdekében. Ezen túlmenően, ha a talaj nehézfémekkel szennyezett, bizonyos növényeket is fel lehet használni a szennyezőforrások elnyelésére.